2023年昆明理工大学生物信息学方向代绍兴课题组，接受2名调剂生

大家好，我来自昆明理工大学灵长类转化医学研究院/省部共建非人灵长类生物医学国家重点实验室，代绍兴。

我们目前接受调剂2名生物信息学方向研究生，欢迎大家咨询了解，邮箱daishaoxing@163.com。

我的简历见网址：http://www.lpbr.cn/daisx

 

目前是生物信息大数据平台负责人，长期开展“靶标识别与精准调控”研究，专注于利用化学生物信息学和人工智能等工具，整合疾病的多组学数据，开展疾病的靶点识别和新药物发现。以传统中草药和天然产物为出发点，开发了一系列针对多种疾病（传染疾病、癌症、神经退行性疾病等）和多种靶点的活性化合物预测方法和平台。为了提高药物研发效率，基于机器学习和深度学习以及化学信息学理论，开发了药物智能研发系统(DrugPredict)。研究兴趣涉及系统生物学、结构生物信息学、药物发现以及人工智能在转化医学中的运用。在Cell、Science Advances、Protein & cell、Journal of Alzheimer's Disease等期刊上发表40余篇SCI研究论文，文章被引用900余次。授权发明专利10余项。主持国家自然科学基金和云南省研究项目5项。

 

主要研究方向有：

1）通过整合严重疾病中的多组学数据发掘和鉴定治疗靶标(系统生物学)

2）对治疗靶点及其药物结合口袋进行三维结构分析和可视化(结构生物信息学)

3）筛选和设计能够靶向和调控治疗靶点的先导化合物(药物发现)

4）机器学习和深度学习在转化医学中的运用

 

省部共建非人灵长类生物医学国家重点实验室（以下简称“国重”）是在昆明理工大学灵长类转化医学研究院和云南中科灵长类生物医学重点实验室的基础上组建，于2021年经国家科技部批准建设运行，围绕国家发展战略目标。“国重”开展以人口健康为导向，以非人灵长类生物医学为核心的重大基础科学问题和复杂疾病机制与治疗的应用基础研究，设置灵长类生殖与发育调控、灵长类干细胞与组织工程、灵长类动物模型与疾病机制研究等三个研究方向，在灵长类基础和应用基础等研究在国际上处于领先水平，持续在国际顶级杂志发表了一系列有重大国际影响的成果。2014年首次实现了基因编辑猴模型（Cell，2014；Cell Stem Cell 2014），被麻省理工评论（MITReview）评为当年十大科技突破，《Nature》评为里程碑式的工作；2015年首次证明了灵长类胚胎干细胞等多能性（Cell Stem Cell，2015），为干细胞再生医学奠定了理论基础；2017年建立了人类RTT综合症等一批猴模型（Cell，2017等），解决了一些其它物种（如啮齿类）所不能回答的重要疾病表型和机制问题；2019年突破猴胚胎体外长时间培养20天（Science, 2019），首次阐述了人胚胎三维条件原肠发育（Nature，2020）。首次发现了灵长类胚胎发育的一些重要分子调控机制、及其与啮齿类明显差异的事实，对解析发育生物学和干细胞多能性等前沿基础科学问题，促进人们对灵长类早期着床后平台发育以及出生缺陷和发育障碍机制理解有重要意义。国重现有科研实验面积8000余平米，包括基因工程实验室、遗传学实验室、干细胞实验室、模型分析实验室、灵长类动物实验平台、蛋白平台、先进影像平台和生物信息大数据平台在内功能齐全的实验空间。此外，重点实验室拥有可容纳1000余只灵长类动物的室外动物房和300笼位的室内动物房，所有动物实验设施均通过国际AAALAC认证。

 

国重概况

省部共建非人灵长类生物医学国家重点实验室/昆明理工大学灵长类转化医学研究院（以下简称“国重”）是在云南中科灵长类生物医学重点实验室的基础上组建，于2021年经国家科技部批准建设运行。

 

“国重”秉承一致的科研理念，一直活跃在灵长类生物医学研究的最前沿，围绕国家发展战略目标，开展以人口健康为导向，以非人灵长类生物医学为核心的重大基础科学问题和复杂疾病机制与治疗的应用基础研究，探索生命的发生、发育和衰老、意识与行为等重大基础科学问题，破解复杂疾病的致病机制，将对疾病治疗的技术革命和原始创新起到巨大推动，最终也将为人口健康提供可靠保障。

2.研究方向

灵长类生殖与发育调控方向

 

以灵长类动物为主，围绕生殖与发育重大基础问题，开展生殖细胞进化发育的分子机制、早期胚胎发育及细胞谱系分化研究，推动相关领域的重大理论突破。

 

灵长类干细胞与组织工程方向

 

围绕干细胞的临床转化关键技术的突破进行系统研究，加强学科交叉，研发标准化干细胞培养体系和产品，研究干细胞多能性与组织工程、干细胞制备和生物材料在干细胞转化中的作用。

 

灵长类动物模型与疾病机制方向

 

建立和优化灵长类靶向基因编辑技术，建立人类复杂疾病的灵长类动物模型，破解复杂疾病的致病机制，完成基于灵长类动物疾病模型的干细胞和基因治疗的临床前研究，推动新技术治疗疾病临床转化和产业化。

3.人才队伍

国重现有共15个研究课题组，实验动物、蛋白、影像、生物材料、生物信息5个支撑平台，专职科研人员及研究助理120余人，在读硕士、博士研究生约200人。包括中国科学院院士/欧洲科学院院士1人，国家高层次人才特聘教授2人，国家杰出青年基金获得者1人，国家高层次人才青年学者1人，国家高层次青年人才1人，国家重点研发计划首席科学家2人，国家自然科学基金重点项目负责人3人，云岭学者2人，云南省高层次人才6人，中青年学术和技术带头人（后备人才）7人，云南省高端外国专家1人。

4.科研项目

近五年，省级项目21项，资助金额高达1.9亿以上。国家级自然科学基金项目31项，含主持国家重点研发计划2项，获资助约1.5亿元；基于国家和省部级科研经费支持，实验室产出高水平科研论文成果120余篇（含CNS论文5篇），发明专利授权8项，获得省级以上科技奖励6项。

5.成果简介

在国际上首次实现灵长类靶向基因编辑，并建立发育、衰老和神经退行疾病灵长类动物模型。入选2014年全球十大科技创新。

在国际上首次获得并证实灵长类胚胎干细胞具有多能性，为干细胞临床应用奠定重要基础。

在国际上首次建立人、猴着床后胚胎体外培养和研究体系，首次系统回答了灵长类原肠发育分子机制。

在国际上首次利用人、猴体外嵌合研究体系回答了人多能干细胞的异种嵌合能力，为异种器官再造奠定理论依据。